Il Museo Archeologico contiene una delle più importanti collezioni d’arte etrusca del mondo. Ha sede nel Palazzo della Crocetta, che fu costruito per la granduchessa Maria Luisa d’Austria nel 1620, probabilmente da Giulio Parigi.
Istituito nel 1870, il museo fu collocato nella sede attuale nel 1880.
Oggi è possibile vedere gran parte delle antiche collezioni mediceo-lorenesi (ceramiche, bronzi e altre sculture litiche, incluso il Monetiere, una delle principali raccolte di monete e gemme antiche fra le più grandi e prestigiose del mondo), il Museo Egizio (inclusa una scelta delle stoffe copte), parte della sezione topografica, con grandi complessi funerari etruschi provenienti da tombe principesche, il giardino monumentale e una ricca selezione dei vasi greci rinvenuti nelle tombe etrusche (e non solo), alcuni di quali rinomati in tutto il mondo, come il celebre Vaso François.